Обучение в 7 – 11-х классах МБОУ СШ № 59 ведется на основе Базисного учебного плана и примерных учебных планов для образовательных учреждений, утвержденных приказом Министерства образования РФ от 09.03.2004 г. № 1312 (в редакции приказов Минобрнауки России от 20.08.2008 № 241, от 30.08.2010 № 889, от 03.06.2011 № 1994); федерального компонента государственного стандарта общего образования, утвержденного приказом МО РФ от 05.03.2004. № 1089; регионального учебного плана общеобразовательных учреждений Архангельской области, утвержденных приказом департамента образования, науки и высшей школы администрации Архангельской области от 07.04.2004. № 387.